Bioinformatique

Bioinformatique

FINDMED vous permet d’avoir accès aux ressources méthodologiques et technologiques (algorithmes et logiciels) de ses partenaires académiques. Nous disposons d’outils pour répondre à vos problématiques R&D nécessitant une expertise dans le domaine de la bioinformatique et de la chémo-informatique.
 

Les activités des instituts Carnot experts en ce domaine visent à développer des modèles et des algorithmes pour analyser et comprendre les données biologiques et chimiques, en particulier au travers de modèles probabilistes et d’algorithmes d’apprentissage statistique. Vous pourrez profiter de ces expertises pour vos projets innovants ayant des applications en diagnostic, pronostic et médecine de précision.

 

Nos principales missions sont de vous apporter un support en bioinformatique, en analyse de données et pour vos calculs à haute performance. Les données obtenues à partir de technologies à haut-débit, telles que le séquençage, la spectrométrie de masse, les puces protéiques, le phénotypage cellulaire ou les microarrays, peuvent être analysées statistiquement.

Nos équipes ont également l’expertise pour développer des bases de données avec interface web sécurisée permettant de générer des rapports d’analyses dynamiques.

 

L’expertise de nos partenaires en chémo-informatique constitue un outil d’aide à la conception rationalisée de principes actifs par la modélisation moléculaire des interactions ligands-cibles. Elle permet à travers des techniques de drug design « structure-based » ou « ligand-based » l’exploitation de chimiothèques.

 

Une activité de data mining, mettant en évidence des fragments moléculaires potentiellement utiles pour la prise en charge thérapeutique d’une maladie correspondant à un phénotype particulier, est également disponible.

Axes thématiques

  • Bases de données
  • Statistiques
  • Informatique
  • Calculs haute performance
  • Drug design
  • Data mining
  • Chimiothèques
  • Santé animale

Services

  • Analyse bioinformatique et biostatistique des données : NGS, spectrométrie de masse, puces protéiques en phase reverse (RPPA), phénotypage cellulaire, etc.
  • Elaboration et application de méthodologies statistiques
  • Définition, implémentation et accessibilité pour le process de données de omics haut débit
  • Conseil en biostatistique et en bioinformatique
  • Conseil méthodologique et assistance dans le design et l’interprétation d’études biomédicales
  • Accès au calcul à haute performance
  • Accès à des stations de travail bioinformatique
  • Accès à des logiciels d’analyse de données

  • Architecture de système d’information pour bases de données
  • Installation et modélisation de bases de données
  • Développement d’interfaces web sécurisées
  • Modélisation de « Datawarehouses » et « Datamarts »
  • Développement de rapports dynamiques
  • Développement et sécurisation de bases de données pour les essais cliniques

  • Aide à la conception rationalisée de principes actifs
  • Drug design : exploitation chimiothèques
  • Data mining : mise en évidence de fragments moléculaires

  • Docking
  • Apprentissage statistique sur des bases de données de molécules
  • Chémogénomique

  • Planification de traitement en radiothérapie
  • Modélisation
  • Simulation de la dose reçue par le patient

  • Analyse bioinformatique et biostatistique de données de transcriptomique : analyse microarray, analyse par RT-qPCR
  • Logiciels de calculs, analyse et modélisation