OMIQUES
Le consortium FINDMED vous facilite l’accès à ses plateformes technologiques « OMIQUES » (génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique) pour l’analyse de biomolécules. Notre volonté est de vous permettre d’identifier et de développer de nouvelles stratégies de diagnostic, de nouveaux marqueurs et de nouvelles cibles biologiques selon vos besoins d’innovation.
FINDMED vous ouvre les portes de ses plateformes « OMIQUES » dont les activités vont de la gestion de projets de protéomique et de génomique à haut débit, à l’analyse d’expression et de méthylation de l’ADN.
Nos activités visent à mettre en œuvre les applications les plus communes de génétique et épigénétique. Elles visent également à développer des approches innovantes en protéomique structurale. En métabolomique, nos activités portent sur le développement de stratégies d’ingénierie analytique dont des approches spectrométriques pour l’identification et la caractérisation structurale des métabolites présents dans un organisme. Une des principales missions de nos plateformes est de développer et d’implémenter de nouveaux protocoles afin de répondre à vos besoins R&D les plus spécifiques.
Axes thématiques
- Génomique
- Transcriptomique
- Protéomique
- Métabolomique
- Recherche clinique
- Microbiologie clinique
Vous souhaitez caractériser des nouveaux modèles de peau ? Identifier des biomarqueurs moléculaires d’exposition ou de susceptibilité ? Caractériser l’effet de traitements ? Ou encore différents microbes ?
FINDMED possède les outils technologiques et l’expertise « OMIQUES » indispensables pour faire avancer vos projets de recherche et d’innovation.
Services
Séquençage d’exomes et de panels de gènes
- Librairies pour le séquençage New Generation Sequencing (NGS)
- Analyse du transcriptome (RNAseq ciblant les ARNm, les ARN non-codants et les petits ARN)
- Caractérisation de l’épigénome : méthylation de l’ADN, ChIP-seq pour étudier les modifications des histones et l’identification des sites de fixation de protéines à l’ADN
- Séquençage de l’ADN génomique et des ARN de cellules uniques
- Support bioinformatique
Identification de protéines peu abondantes dans des matrices biologiques complexes
- Stratégies de protéomique quantitative avancée
- Caractérisation de modifications post-traductionnelles (PTM) par pontage covalent combiné à la spectrométrie de masse (chimie click)
- Analyse et dynamique de complexes protéiques : protéomique top-down, spectrométrie de masse native
- Étude des interactions protéine-protéine : approche HX-MS
- Épitope mapping : échange H/D couplés à la spectrométrie de masse, HX-MS
- Identification et caractérisation structurale de métabolites par spectrométrie de masse et RMN
Identification de protéines peu abondantes dans des matrices biologiques complexes
- Puces à ADN
- Création des puces (préparation des plaques 384 puits, dépôt sur puce en plusieurs dilutions et plusieurs réplicats par échantillon)
- Révélation des puces avec des anticorps primaires
- Hybridation de microarray
- Banques BAC
- PCR en temps réel (quantification d’ARN, PCT digital, SybrGreen)
- Purification et analyse de produits de PCR (ADN et ARN)
- Analyse des niveaux d’expression de protéines d’intérêts dans les conditions normales et sous l’effet d’agents extérieurs (pathologies, traitements médicamenteux, environnement, etc.).
- Étude de l’activation des voies de signalisation cellulaire et leur dynamique
- Identification des cibles thérapeutiques
- Validation de nouveaux anticorps primaires
- Prise en charge des échantillons : lyse protéique, dosage par kit BCA (BiCinchoninic acid Assay)