La génomique numérique

La génomique numérique

FINDMED sera au colloque : La génomique numérique, interpréter et agir

 

La génomique numérique, une science nouvelle qui se décline à Genopole ! Elle vous sera expliquée le jeudi 21 novembre à la Bibliothèque Nationale de France lors d’un colloque construit avec le comité scientifique. Le colloque mettra en perspective les défis scientifiques, techniques et sociétaux à relever. Damien Salauze, directeur des opérations de FINDMED, sera présent à cet événement et représentera FINDMED et les instituts Carnot membres du consortium

BIBLIOTHÈQUE NATIONALE DE FRANCE, PARIS
JEUDI 21 NOVEMBRE 2019

Le numérique s’impose pour que de la génomique, naissent bientôt des applications pour la médecine de précision, l’environnement, l’agronomie, l’agro-alimentaire. La génomique numérique participera à relever le défi de notre « santé globale ».

La génomique numérique, plus précisément computationnelle, est un champ de recherche à l’interface entre la biologie et l’informatique. Elle s’attache à inventer de nouvelles méthodes d’exploration des données de séquences des génomes, transcriptomes (expression des gènes, ARN non codants…), épigénomes, voire métagénomes dans le cas d’études de communautés d’organismes : un large domaine d’investigation qui inclut l’intégration des données génomiques et phénotypiques, leur interprétation, l’automatisation des analyses, les approches de modélisation et simulation, l’intelligence artificielle, le machine learning…

Une véritable filière académique et industrielle de la génomique numérique se construit peu à peu. Le colloque mettra en perspective les défis scientifiques, techniques et sociétaux à relever.

 

PROGRAMME PRÉVISIONNEL
8h30 Accueil
9h00 Ouverture
Jean-Marc Grognet, directeur général de Genopole
9h15 Keynote lecture
From Genomics to Therapeutics : dissecting disease circuitry at single-cell resolution
Manolis Kellis, MIT Computational Biology Group
10h00
Session 1
Défis techniques et technologiques du traitement des données génomiques, médicales et autres

1- Particularités et problématiques des données de génomique humaine – Emmanuelle Génin, Inserm
2- Intégration de données omiques pour la compréhension des écosystèmes – Christophe Ambroise, LaMME (Université d’Evry, ENSIIE)

11h00 Pause
11h30
Session 2 
Explorer la partie non codante du génome

1- La place de l’épigénétique en élevage : outils d’analyse et de diagnostic – Hélène Jammes, Inra
2- Prédiction des ARN non codants – Fariza Tahi, Ibisc (CNRS, Inra, Université d’Evry, ENSIIE)

12h15 Pitchs de start-up
12h40 Déjeuner
14h00
Session 3
Des données à l’information, aux connaissances

Serge Abiteboul, Inria-ENS

14h30
Session 4 
IA pour la génomique

1- Intelligence artificielle et génomique : attentes, premiers résultats et limites
Florence d’Alché-Buc, Télécom ParisTech
2- Interprétation des réseaux de neurones dans le cadre de la transcriptomique – Blaise Hanczar, Ibisc (Université d’Evry, ENSIIE)

15h15 Pause
15h45
Session 5 
Vision des industriels

1- Computational Drug Repositioning in the Big Data and AI Era – Mickaël Guedj, Servier
2- La génomique au service de la sélection – Nicolas Heslot, Limagrain Field Seeds

16h45
Session 6
Table ronde : Enjeux éthiques et sociétaux

Christine Balagué, Institut Mines-Télécom Business School
Mélanie Clément – Fontaine, Université Versailles St Quentin
Serge Abiteboul, Inria-ENS

17h15 « Garbage in, garbage out » : pour une approche fonctionnelle de la génomique
Antoine Danchin, AMAbiotics, Institut Cochin
17h45 Clôture